ビジター艇の利用料の徴収で最も多い方法は、銀行・郵便振り込みが88漁港で、次に現地で現金徴収が9漁港、クレジットカード決済が1漁港（初島フィッシャリーナ）で実施されている。

　また、その他の方法としては市町村発行の納付書による納付（北海道）、県証紙による納付（沖縄県）、町の会計課に直接納付、利用料金制で管理運営受託者の収入となるケース（フィッシャリーナ天草）がある。

　ビジター艇受入れ後、漁港管理者の事務量の変化をみると、事務量が増え負担が大きいと回答が87漁港（67%）で、特に事務量は発生していないが17漁港（13%）および通常の事務量で処理できているが16漁港（12%）を大幅に上回っている。

　ビジター艇受入れ後の漁港管理者の事務量が変化した内容については、電話対応が最も多く全体の87漁港、次に書類作成・苦情処理が各85漁港、事故処理は無く、その他事務内容として、毎日の港の見回り、未届船の有無調査、届出提出指導や地元関係者への連絡等が挙げられた。