また、モニタリングにより、アンモニアと窒素の濃度が安全と判断される規定の量を超えないよう監視し、その結果から、栄養塩濃度を安全値の最大限に設定することが望まれる。ただし、バイオレメディエーションの効果は、様々な環境要因に左右されるので、一律の適用基準は設けにくいと言える。状況に応じた判断が必要である。

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