わが国は1957年8月31日にマレーシアとの国交を樹立し、60年に通商協定、65年に航空協定、70年に租税協定など2国間協定を締結し、経済面のみでなく、経済・技術協力、文化協力などを通じ、両国間関係は全般的に友好・親善裡に推移している。
貿易関係では、わが国はマレーシアにとって第1の貿易相手国（輸出入貿易総額が最大）であり、93年の対日輸出の総輸出額に占める割合は13．0%で、シンガポール、米国に次ぎ第3位、同輸入は27．4%で第1位となっている。
両国間の貿易関係は、日本側通関統計によると、76年以来日本の入超で推移し、特に84年以降は液化天然ガス（LNG）の対日輸出が本格化する反面、わが国の対マレーシア輸出が低迷したため、マレーシアの対日貿易黒字は大幅に拡大し、87年には26億米ドルを記録した。しかし、90年以降は逆にマレーシア側の入超に転じ、9偉にはマレーシアの対日赤字は約41億3，400万米ドルとなった。
4年のマレーシアの対日輸入を品目別にみると、機械・輸送機器が輸入総額の70%を超える292．5億リンギ（前年比33．6%増）、次いで原料別製品が62．3億リンギ（同15．6%増）、化学品が270億リンギ（同33．4%増）と、いずれも2ケタの伸びを示している。
輸出品目でも、機械・輸送機器が64．7億リンギ（前年度比40．1%増）で、鉱物性燃料を抜いて第1位を占め、輸出総額に占める割合も35．2%となっている。
一方、鉱物性燃料（原油、液化天然ガス等）は、42．7億リンギ（同1．2%減）で、輸出総額に占める割合は91年の36．9%をピークとし、漸次低下している。
天然ガスは従来、全量を日本へ輸出していたが、94年には日本向けが総量の96%となっており、新規輸出先として韓国が参入している。また、鉱物資源も29．4億リンギ（同8．4%減）と89年以降減少傾向にある。
