保存船=6次にわたる南極観測に活躍した海上保安庁の「宗谷」(保存船の宗谷の欄参照)。船の科学館にはここに掲載した保存船のほかに、超電導電磁推進実験船の推進装置部分、潜水艇「たんかい」、戦艦「大和」の1/10模型などが屋外に展示されている。
保存船=青函連絡船津軽丸型の6番船「羊蹄丸」。フローティングパビリオンとして船内には「青函ワールド」などの展示がある(保存船の羊蹄丸の欄参照)
保存船=実験船で半没水型双胴船の「マリンエース」(保存船のマリンエースの欄参照)
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