船の科学館では、総合的学習等への対応施設として、海事関係図書資料が閲覧できる読書ルームや参加体験学習専用桟橋のほか、来館者へのサービス施設として、4つのレストランと4ヶ所の多目的ホールやミュージアムショップ、屋外プール等の施設を設けています。